En fait, lorsqu'une micro-onde traverse de la matière, elle est capable de faire bouger les molécules qui sont sensibles au champ électrique : une micro-onde est en effet une perturbation du champ électrique et du champ magnétique. Et notamment, parmi les molécules qui nous entourent, il en est une qui est particulièrement sensible à ce champ électrique : c'est la molécule d'eau, même si ça n'est pas la seule. Lorsqu'une micro-onde passe, la molécule d'eau est "bousculée" par le champ électrique. Elle se tourne successivement d'un côté et de l'autre à grande vitesse (au rythme de l'onde qui la fait bouger, un peu comme un bouchon monte et descend avec une vague, sauf que là, c'est un peu comme si la vague ne soulevait pas le bouchon, mais le faisait se retourner). Donc, les micro-ondes agitent les molécules d'eau.

Les molécules d'eau sont en fait sensibles au champ, et assez petites pour se retourner facilement. En se retournant, elles cognent les autres molécules d'à côté, et du coup, toutes les molécules autour s'agitent, si les micro-ondes sont assez fortes. Or l'agitation des molécules, c'est leur température ! Donc les micro-ondes chauffent la matière ! L'avantage, c'est qu'elles se comportent sinon comme des ondes radio, et sont réfléchies par le métal. Donc le four lui-même n'est pas chauffé par les micro-ondes. Il n'y a que la nourriture qui l'est et directement au coeur, ce qui représente une énorme économie d'énergie, et un grand gain de temps (plus besoin de préchauffer le four !).

Au passage, il est mauvais de mettre des objets métalliques dans un four micro-ondes, parce que le métal réfléchit les ondes. En général, cela se termine par un gros paquet d'étincelles entre le métal et les parois du four. A déconseiller, donc ! 

Une ouverture du sujet...

Les micro-ondes sont pratiques pour la transmission d'information, parce qu'elles se comportent en fait exactement comme des ondes radio. Le principe des téléphones portables est le même que celui de la radio. Les micro-ondes ont par contre une moins grande portée, mais pour ce qui est des téléphones portables, c'est un avantage, comme ça, il n'y a pas besoin d'accorder une fréquence nationale à chaque possesseur de téléphone !

Le problème bien sûr, c'est : est-ce que ce qui se passe dans le four ne risque pas de se reproduire à cause du téléphone portable dans notre cerveau, avec les conséquences que l'on devine (en fait, surtout des cancers) ?

Et une question fondamentale : pourquoi les mouches résistent-elles au micro-ondes ?
Après tout, elles contiennent elles aussi de l'eau.

La chaleur que l'on produit par les micro-ondes est due à l'absorption de cette fréquence par les molécules d'eau contenus dans la matière (essayez de faire chauffer des aliments desséchés comme de la soupe en poudre sans eau et vous verrez le résultat). La mouche contient quand même de l'eau et il est probable qu'elle ait eu très chaud pendant son irradiation au micro-ondes, mais certaines mouches (comme d'autres insectes : fourmis, scorpions, etc) sont parfois "dures à cuire". La quantité d'eau contenue dans la mouche ne doit pas être suffisante pour provoquer les effets désastreux tels qu'on aurait pu les rencontrer chez un être composé essentiellement d'eau (comme un animal mammifère ou un poisson!!). Pour avoir un aperçu de ce que ça pourrait donner, mettez un oeuf cru et entier dans sa coquille à chauffer dans le micro-onde et attendez de voir un changement significatif dans l'état physique de l'oeuf (il faut par contre le mettre dans un récipient fermé pour éviter un grand nettoyage de printemps du micro-ondes).

En réalité, la mouche ne doit pas pouvoir survivre à un tel traitement : toutefois, le fait par exemple que l'essentiel du rayonnement micro-onde se concentre au centre du four, et qu'en principe l'expérience se fait fortuitement et en présence d'un aliment à réchauffer, les rayonnements peuvent ne pas se propager dans la four tout entier (alors que s'il est vide, il y aurait de multiples réflexions sur ses parois métalliques) et ainsi donner du répit à notre mouche.